一、职位不同：科技局属于国家行政机关，里面就是所谓的公务员。

科协属于社会团体，但比较特殊，是参照公务员法管理单位，编制由组织部确定，属于同级相关主管部门管辖下，相同性质的还有作协，红十字会等。

二、职能不同：科协主要任务是开展学术交流，活跃学术思想，促进学科发展，推动自主创新。

中国科协以及省市区科协的一些下属单位是事业单位。

科技局是管理科技事物、行政执法。

扩展资料：贯彻执行国家有关科学技术的方针、政策和法律、法规；研究制定科学技术发展和用科学技术促进经济社会发展的政策措施；会同有关部门制定科技体制改革和科技创新体制改革的总体方案并组织实施。

2、研究拟订科学和技术发展战略、中长期规划和年度计划;研究提出科学技术资金合理配置的意见和建议;负责科学事业费、“三科技费”和其他集中管理的有关经费的预算、决算。

3、研究提出高新技术发展规划和产业政策措施，并组织实施；负责高新技术企业、高新技术产品和高新技术成果转化项目的申报和认定；指导高新技术产业开发区和科技示范园区的工作；参与高科技风险投资管理。

4、研究制定加强技术创新和科技成果产业化的政策措施；组织实施科技计划、火炬计划、星火计划、科技成果推广计划、农业种植产业化计划、国家科技创新试点城市计划、可持续发展示范工程；组织协调产学研结合，加强企业与高校、科研机构的科技结合与合作。