一篇新的研究论文发表在 Oncotarget 上,题为“G-quadruplex Landscape and its adjustment Revealed by a new Antibody capture method”。
在这项新研究中,来自印度甘地讷格尔理工学院、印度海得拉巴理工学院、伦敦玛丽女王大学的研究人员 Subhamoy Datta、Manthan Patel、Chakkarai Sathyaseelan、Chandrama Ghosh、Akanksha Mudgal、Divyesh Patel、Thenmalarchelvi Rathinavelan 和 Umashankar Singh,巴伊兰大学、卢布林医科大学和赫尔辛基大学讨论了引起广泛关注的 DNA 二级结构,即 G-四链体或 G4。
“我们通过体外研究对 DNA G 四链体 (G4) 的理解得到了来自培养细胞的全基因组 G4 景观的补充。”
传统上,G4 的形成被认为依赖于 G 重复,从而形成四分体。然而,通过高通量测序表征的全基因组 G4表明,这些结构在大量区域形成,而没有此类规范的 G4 形成特征。许多 G4 结合蛋白已被描述,但没有任何证据表明任何蛋白质可以结合并稳定 G4。
“目前尚不清楚人类细胞中形成的 G4 的哪一部分是与蛋白质结合的。”
迄今为止用于描述 G4 景观的 G4-染色质免疫沉淀 (G4-ChIP) 方法优先报告与其附近的蛋白质交联的 G4。目前对 G4 景观的理解有偏见,不利于 G4 的表征,G4 可以避免交联,因为它们不能通过蛋白质结合来稳定,并且可能是短暂的。