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新方法揭示地下生命隐藏的活动

导读 由毕格罗海洋科学实验室的研究人员领导的一组科学家开发了一种创新方法,将生活在地球表面深处无氧环境中的单个微生物的遗传学和功能联系起...

由毕格罗海洋科学实验室的研究人员领导的一组科学家开发了一种创新方法,将生活在地球表面深处无氧环境中的单个微生物的遗传学和功能联系起来。测量这两个属性——更重要的是,将它们联系在一起——长期以来一直是微生物学的一个挑战,但对于理解微生物群落在碳循环等全球过程中的作用至关重要。

毕格罗实验室单细胞基因组中心开发的新方法使研究人员能够发现,一种消耗硫酸盐的细菌不仅是死亡谷下方地下水含水层中最丰富而且最活跃的生物体,该地下水层位于死亡谷下方近半英里处。表面。

发表在《美国国家科学院院刊》上的研究结果表明,这种方法如何成为测量这些极端环境中不同生物体活跃程度的有力工具。

“以前,我们必须假设所有细胞都以相同的速率运行,但现在我们可以看到,微生物群落的各个成员之间的活动水平存在很大差异,”研究科学家兼论文第一作者 Melody 说林赛. “这有助于我们了解这些微生物群落的能力以及它们如何影响全球生物地球化学循环。”

最近的研究是一个更大项目的一部分,该项目将微生物的遗传密码(它们能力的蓝图)与它们在任何特定时刻的实际行为联系起来。

“从基因组到现象组”项目是毕格罗实验室、沙漠研究所和新罕布什尔大学的合资项目。它利用单细胞基因测序的最新进展,采用流式细胞术的创造性方法来估计这些细胞内发生的过程(例如呼吸)的速率。

流式细胞术是一种分析个体环境微生物的方法,毕格罗实验室根据生物医学科学进行了改造,使研究人员能够快速筛选出含水层水样中的活微生物。这些微生物被一种特殊设计的化合物染色,当细胞内发生某些化学反应时,该化合物会在流式细胞术激光下发光。

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