在最近发表在Nature Genetics上的一项研究中，金泽大学纳米生命科学研究所 (WPI-NanoLSI) 的研究人员探索了染色质可及性，即基因组 DNA 的内源性访问途径，及其作为基因编辑工具的用途。

我们的 DNA 通过形成称为核小体的结构来保护其免受不需要的外部修饰，核小体由缠绕在称为组蛋白的特殊蛋白质块周围的 DNA 线组成。这种独特的卷曲形状可防止不良分子进入细胞 DNA。然而，对于重要的遗传功能(例如 DNA 修复)，正确的蛋白质组需要访问这些 DNA 片段。这种被称为“染色质可及性”的现象涉及一组特殊的蛋白质分子，其中许多仍然未知。

现在，金泽大学纳米生命科学研究所 (WPI-NanoLSI) 的研究人员在 Yusuke Miyanari 的领导下，使用先进的基因筛查方法来解开染色质的可及性及其途径。

在这项调查中，该团队结合使用了两种技术——CRISPR 筛选和 ATAC-see。前者是一种抑制一组所需基因功能的方法，而后者是一种识别哪些基因对于染色质可及性至关重要的方法。因此，使用这种方法可以确定在染色质可及性中发挥关键作用的所有基因。

在这些检测的帮助下，发现了参与染色质可及性的新途径和个体参与者——一些发挥积极作用，一些发挥消极作用。其中，一种特殊的蛋白质 TFDP1 对染色质可及性表现出负面影响。当它被抑制时，观察到染色质可及性显着增加，并伴有核小体减少。

对 TFDP1 机制的深入研究表明，它通过调节负责产生某些组蛋白的基因来发挥作用。

然后，该团队将研究重点放在探索其发现的生物技术应用上。抑制 TFDP1 后，尝试了两种不同的方法。第一种方法涉及使用 CRISPR/Cas9 工具进行基因编辑。