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LipidOz:新软件能够识别脂质双键位置

导读 脂质是一类在许多细胞过程中发挥重要作用的生物分子。旨在表征样品中所有脂质的分析(称为脂质组学)对于研究复杂的生物系统至关重要。脂质组...

脂质是一类在许多细胞过程中发挥重要作用的生物分子。旨在表征样品中所有脂质的分析(称为脂质组学)对于研究复杂的生物系统至关重要。

脂质组学的一个重要挑战是将脂质的多种结构与其生物学功能联系起来。脂肪酸链内双键的位置尤其重要。这是因为它们可以影响细胞膜的物理特性并调节细胞信号传导途径。

这些信息在脂质组学研究中并不常规测量,因为它需要复杂的实验装置来产生复杂的数据。因此,太平洋西北国家实验室 (PNNL) 的科学家开发了一种简化的工作流程来确定双键的位置。该工作流程同时使用自动化和机器学习方法。

他们的新方法 LipidOz 简化了数据分析以确定双键的位置。通过解决脂质分析的这一关键部分,LipidOz 为研究人员提供了一种更有效、更准确的脂质表征方法。该研究发表在《通讯化学》杂志上。

由于具有相同化学式但不同物理构型的分子部分的存在,脂质的明确识别变得复杂。具体来说,这些分子部分的差异包括脂肪酰基链长度、立体特异性编号(sn)位置和双键的位置/立体化学。

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